Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp54Q8BL06 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp54Q8BL06 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp54Q8BL06 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms