Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm29Q8BGX2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm29Q8BGX2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm29Q8BGX2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm29Q8BGX2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm29Q8BGX2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Timm29Q8BGX2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Timm29Q8BGX2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms