Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Bhlhe23Q8BGW3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe23Q8BGW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms