Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vipas39Q8BGQ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
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Vipas39Q8BGQ1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Vipas39Q8BGQ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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