Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SynprQ8BGN8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SynprQ8BGN8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms