Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sv2bQ8BG39 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sv2bQ8BG39 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms