Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-M10.5Q85ZW7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms