Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srgap3Q812A2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Srgap3Q812A2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms