Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8Q80YR6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8Q80YR6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms