Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrfn4Q80XU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrfn4Q80XU8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrfn4Q80XU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrfn4Q80XU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lrfn4Q80XU8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrfn4Q80XU8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lrfn4Q80XU8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrfn4Q80XU8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms