Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcsk9Q80W65 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Pcsk9Q80W65 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Pcsk9Q80W65 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcsk9Q80W65 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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