Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClmQ7TSN2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms