Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf516Q7TSH3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf516Q7TSH3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms