Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dsg1bQ7TSF1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms