Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnfsf18Q7TS55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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