Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim12Q78RX3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms