Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps27Q6ZWU9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps27Q6ZWU9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms