Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b3Q6UQ17 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp8b3Q6UQ17 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Atp8b3Q6UQ17 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp8b3Q6UQ17 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Atp8b3Q6UQ17 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Atp8b3Q6UQ17 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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Atp8b3Q6UQ17 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Atp8b3Q6UQ17 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms