Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atl2Q6PA06 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atl2Q6PA06 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms