Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Podnl1Q6P3Y9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Podnl1Q6P3Y9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms