Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Szrd1Q6NXN1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Szrd1Q6NXN1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms