Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frem2Q6NVD0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frem2Q6NVD0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms