Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Best3Q6H1V1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Best3Q6H1V1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Best3Q6H1V1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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