Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nckap5lQ6GQX2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nckap5lQ6GQX2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms