Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nop58Q6DFW4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop58Q6DFW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms