Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrmQ64674 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SrmQ64674 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SrmQ64674 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SrmQ64674 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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