Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou4f3Q63955 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou4f3Q63955 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms