Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lcn4Q62472 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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