Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vat1Q62465 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms