Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssr4Q62186 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssr4Q62186 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms