Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
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Sema3cQ62181 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sema3cQ62181 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sema3cQ62181 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sema3cQ62181 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sema3cQ62181 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sema3cQ62181 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema3cQ62181 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms