Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Rbm38Q62176 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Rbm38Q62176 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rbm38Q62176 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rbm38Q62176 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbm38Q62176 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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