Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrn1Q61809 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms