Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gli3Q61602 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gli3Q61602 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms