Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccne1Q61457 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccne1Q61457 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms