Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd53Q61451 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cd53Q61451 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms