Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PcolceQ61398 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcolceQ61398 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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PcolceQ61398 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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