Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BcanQ61361 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BcanQ61361 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcanQ61361 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BcanQ61361 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BcanQ61361 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms