Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp7Q60973 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp7Q60973 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms