Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbbp4Q60972 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp4Q60972 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms