Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxd4Q60688 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Foxd4Q60688 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms