Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprnQ60673 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PtprnQ60673 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms