Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Satb1Q60611 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Satb1Q60611 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms