Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc5a6Q5U4D8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc5a6Q5U4D8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms