Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r196Q5SVD5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms