Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trdv4Q5R1A3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trdv4Q5R1A3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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