Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm12253Q5NC48 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm12253Q5NC48 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm12253Q5NC48 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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