Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rtl5Q5DTT4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rtl5Q5DTT4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rtl5Q5DTT4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms