Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lrrc47Q505F5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lrrc47Q505F5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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