Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3aQ4TU90 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhox3aQ4TU90 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms